Chiyo Sakura adalah gadis SMA ceria yang jatuh cinta pada Umetarou Nozaki yang tidak sadarkan diri. Yang membuat Chiyo kebingungan, ketika dia mengaku pada Nozaki kesayangannya, dia memberinya tanda tangan yang tidak dikenalnya. Ternyata, remaja laki-laki yang tabah itu sebenarnya adalah mangaka shoujo yang disegani, yang diterbitkan dengan nama pena Sakiko Yumeno! Serangkaian kesalahpahaman menyebabkan Chiyo menjadi salah satu asisten manga Nozaki.
Sepanjang kejadian lucu yang terjadi kemudian, dia berteman dengan banyak teman sekolahnya yang unik, termasuk rekan asistennya yang tampaknya tidak tahu malu, Mikoto Mikoshiba, dan “Pangeran Sekolah”, Yuu Kashima. Gekkan Shoujo Nozaki-kun mengikuti Chiyo saat dia berusaha membantu Nozaki dengan manganya dan berharap dia pada akhirnya akan menyadari perasaannya.
